Bacillus subtilis , notre allié, pour "restaurer la santé planétaire et humaine à partir de la base."

 https://sayerji.substack.com/p/how-bacillus-subtilis-is-quietly

Via : SERGE à https://www.covid-factuel.fr/2024/01/06/forum-2024/

La bactérie ancestrale qui se nourrit de Roundup

Un micro-organisme omniprésent, présent dans les sols sains et les aliments traditionnels du monde entier, pourrait être le chaînon manquant pour restaurer la santé planétaire et humaine à partir de la base.

Sayer Ji

14 mai 2026

Une bactérie ancienne et extrêmement puissante – présente dans nos sols, nos aliments fermentés et notre propre microbiote intestinal – démantèle le glyphosate, protège notre système cardiovasculaire, module notre immunité et nous rappelle que les « microbes » ont toujours été des remèdes.

Il y a une symétrie tranquille, presque poétique, dans la façon dont la nature réagit à la folie humaine.

Nous avons saturé nos sols d'une molécule synthétique conçue pour démanteler la voie du shikimate — cette même voie dont les bactéries de notre intestin ont besoin pour produire les acides aminés qui deviennent nos neurotransmetteurs, nos tissus conjonctifs et nos signaux immunitaires. On nous a assuré que cette molécule était sans danger car l'être humain ne possède pas cette voie du shikimate. Ce qu'on nous a caché pendant des décennies, c'est que nous ne sommes pas uniquement humains . Les 99 % de notre holobionte d'origine microbienne possèdent bel et bien cette voie du shikimate. Le glyphosate , par son mécanisme d'action, est un antibiotique qui s'attaque précisément aux organismes qui nous constituent.

Et pourtant, au sein même de cette biosphère que nous avons si négligemment polluée, se cache une simple et humble bactérie capable de décomposer cette molécule – liaison par liaison – tout en produisant certaines des biomolécules les plus puissantes sur le plan thérapeutique. Elle vit dans le sol sous nos pieds. Elle vit dans les aliments fermentés de toutes les cuisines traditionnelles qui ont survécu à l'industrialisation. Elle vit dans la rhizosphère de nos cultures. Et – comme les chercheurs ne l'ont découvert qu'au cours des vingt dernières années – elle vit dans notre propre tube digestif, où elle œuvre en tant que partenaire commensal discret depuis l'aube de l'humanité.

Son nom est Bacillus subtilis .

Voici l'histoire de la façon dont un microbe ancestral tisse ensemble presque tous les fils de la révolution du microbiome : l' extensibilité de notre biologie grâce à nos partenaires microbiens, la continuité entre le sol et l'intestin qui nous rend inséparables de la Terre vivante, l' intelligence réparatrice de la vie microbienne capable de guérir des dommages que notre propre génome ne peut même pas enregistrer, et l' héritage alimentaire ancestral grâce auquel nos ancêtres ont continuellement renouvelé cette relation bien avant que nous ayons les mots pour la nommer.

Avant d'aborder plus en détail l'aspect scientifique, prenons une image pour illustrer ce que nous entendons par « nous ». L'Homme de Vitruve de Léonard de Vinci — icône de la Renaissance représentant la perfection humaine en tant qu'être autonome et géométriquement complet — a été réimaginé dans la science contemporaine du microbiome sous le nom d' Holobionte : un corps inséparable des milliards de microbes, de champignons, de virus et de molécules de signalisation issues des aliments avec lesquels il vit en dialogue biochimique constant.

Ces petites sphères colorées sont des vésicules (exosomes, vésicules de la membrane externe, microARN d'origine alimentaire) transportant des informations entre règnes, franchissant ce que l'on croyait autrefois des frontières biologiques étanches. Initialement publié dans Trends in Microbiology (composition artistique de Laura Galeazzo). J'ai exploré les implications plus profondes de ce phénomène dans Leonardo da Vinci and the New Biology . Pour le présent article, il suffit de noter que c'est cet organisme avec lequel Bacillus subtilis collabore – et que le glyphosate attaque sans le savoir.

Les dommages causés par le glyphosate à l'holobionte

Pour comprendre pourquoi l' histoire de B. subtilis est importante, il faut d'abord prendre conscience de l'ampleur des dégâts causés par le glyphosate.

Le glyphosate est le principe actif du Roundup et l'herbicide le plus utilisé de l'histoire de l'agriculture. Il est pulvérisé sur les cultures OGM Roundup-Ready, utilisé comme dessiccant avant récolte sur le blé et l'avoine conventionnels, et appliqué dans les champs, sur les pelouses, dans les parcs et en bordure de route sur tous les continents habités. Ses défenseurs industriels affirment depuis près d'un demi-siècle que le glyphosate est sans danger pour les mammifères car ces derniers ne possèdent pas la voie du shikimate – la voie métabolique par laquelle les plantes, les champignons et les bactéries synthétisent les acides aminés aromatiques phénylalanine, tyrosine et tryptophane.

L'argument est techniquement vrai, mais biologiquement erroné. Nous ne possédons pas la voie du shikimate. Notre microbiome, lui, la possède. Les bactéries de notre intestin — notamment les espèces Lactobacillus et Bifidobacterium qui fermentent nos aliments, modulent notre immunité, produisent nos vitamines B et régulent l'axe intestin-cerveau — dépendent de cette voie.¹ ² Il en va de même pour de nombreux champignons de notre mycobiome, ainsi que pour de nombreux organismes du sol qui constituent le substrat vivant sous chaque repas que nous avons consommé.

Ce que les recherches publiées ont désormais clairement démontré – à travers des études in vitro, des modèles animaux et des analyses métabolomiques – c’est que l’exposition au glyphosate supprime sélectivement de nombreux membres bénéfiques du microbiote intestinal, tout en laissant certains pathogènes relativement indemnes. Il a été montré que Lactobacillus et Bifidobacterium sont plus sensibles au glyphosate que Clostridium perfringens et certaines souches de Salmonella.³ L’activité transcriptionnelle de la voie du shikimate a été documentée chez une fraction significative du microbiote intestinal humain,⁴ et des études métabolomiques chez le rat ont confirmé l’accumulation d’intermédiaires de cette voie – la signature biochimique de l’inhibition par le glyphosate – chez des animaux vivants exposés à des doses pertinentes pour l’environnement.⁵ Samsel et Seneff ont été les premiers à exposer les implications plus larges de ce mécanisme pour les maladies chroniques humaines dans leur article de synthèse de 2013 paru dans Entropy , portant sur la suppression par le glyphosate des enzymes du cytochrome P450 et de la biosynthèse des acides aminés microbiens.¹

Voici la nature des méfaits du glyphosate : il ne s’agit pas d’une « toxine humaine » au sens strict de la toxicologie. C’est une toxine qui affecte l’organisme tout entier . Elle cible l’écologie interne qui constitue 99 % de notre identité génétique. Parce que le corps qu’elle empoisonnait n’a jamais été reconnu comme tel par les instances scientifiques qui l’ont approuvée, les dommages ont pu s’accumuler, de génération en génération, jusqu’à se manifester aujourd’hui dans l’épidémie de maladie cœliaque, de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), d’autisme, de dépression, de maladies auto-immunes et de troubles métaboliques qui caractérisent de plus en plus la condition humaine moderne.

Quand on se demande ce que le glyphosate « fait » à une personne, la réponse honnête est : il n’agit pas du tout sur la personne. Il agit sur les communautés microbiennes au sein desquelles la personne vit.

Bacillus subtilis : la bactérie que nous avions oubliée.

Et pourtant, dans ces mêmes sols que l'agriculture conventionnelle a bombardés à outrance, une lignée ancienne de bactéries poursuit son œuvre ancestrale. Parmi elles, Bacillus subtilis .

Bacillus subtilis est l'un des organismes les plus étudiés de toute la biologie. Bactérie Gram-positive par excellence, elle est l'organisme modèle pour l'étude de la sporulation et l'outil indispensable des laboratoires de fermentation du monde entier. Pendant la majeure partie du XXe siècle, les microbiologistes l'ont classée parmi les bactéries du sol – une classification simpliste qui nous permettait de la considérer comme distincte de nous, « là-bas », dans la terre. Cette classification a été discrètement remise en question.

En 2009, des chercheurs de l'Université Royal Holloway de Londres, travaillant avec des souches isolées directement à partir de biopsies de l'iléon et d'échantillons fécaux de personnes en bonne santé, ont démontré que Bacillus subtilis s'était adapté à la vie dans le tube digestif humain.⁶ La bactérie pouvait sporuler en anaérobiose, sécréter des antimicrobiens contre les pathogènes et former des biofilms protecteurs le long de la paroi intestinale. Leur conclusion était sans équivoque : B. subtilis et d'autres bactéries sporulantes devaient être considérées comme des commensaux intestinaux plutôt que comme de simples micro-organismes du sol.⁶ Des études ultérieures ont confirmé et approfondi cette vision, notant que les spores de B. subtilis survivent aux températures de cuisson, à l'acidité de l'estomac et à la bile de l'intestin grêle, et qu'elles germent, se développent et contribuent au métabolisme une fois parvenues dans l'intestin.⁷

Il s'agit là d'une véritable révolution pour le microbiome. Bacillus subtilis n'est pas un organisme extérieur : il fait partie intégrante de notre organisme depuis toujours. Nos ancêtres, se nourrissant de racines et de tubercules non lavés, consommant des aliments fermentés naturellement, buvant de l'eau de source non filtrée et respirant un air chargé de poussière de terre lors des semailles et des récoltes, étaient constamment contaminés par cet organisme. Il a voyagé avec nous, en nous, à nos côtés, à travers les continents et les millénaires. La frontière entre le microbiome du sol et le nôtre, entre les champs et l'intestin, n'a jamais été la ligne de démarcation stricte que l'hygiène moderne imagine. C'était, comme l'a nommé l'herboriste Paul Schulick, un pont de vie – et Bacillus subtilis est l'une des espèces qui le franchissent.

Comment nos ancêtres rencontraient cette bactérie au quotidien

Bien avant que le terme « probiotique » ne devienne un argument marketing, Bacillus subtilis faisait déjà partie intégrante de l'alimentation quotidienne des êtres humains à travers le monde. Cette bactérie vivait dans les aliments que nos ancêtres considéraient comme sacrés – des aliments si souvent associés à la longévité et à la vitalité que les cultures traditionnelles ont bâti des pratiques rituelles entières autour de leur préparation.

La source alimentaire la plus célèbre est le natto , le plat traditionnel japonais à base de soja fermenté dans lequel Bacillus subtilis var. natto transforme les graines de soja cuites en l'un des aliments les plus riches en nutriments et bioactifs jamais recensés dans l'alimentation humaine.⁸ Consommé quotidiennement depuis des siècles dans des régions du Japon associées à une santé cardiovasculaire et une densité osseuse exceptionnelles,⁹ le natto est une culture vivante — chaque cuillerée contient des milliards d' organismes B. subtilis actifs ainsi que la cascade de molécules bioactives qu'ils produisent.

Mais le natto n'est que l'exemple le plus connu. B. subtilis et ses proches parents participent à la fermentation de :

• Kinema, thua nao et pe-poke — les aliments fermentés à base de soja du Népal, de Thaïlande et du Myanmar, des parallèles alimentaires avec le natto, chacun avec ses propres souches indigènes de Bacillus.

• Dawadawa, iru et ogiri — condiments d'Afrique de l'Ouest fermentés à partir de graines de caroube, de soja ou de melon, au cœur des cuisines du Nigeria, du Ghana, du Sénégal et des régions environnantes.

• Cheonggukjang — la pâte de soja coréenne à fermentation rapide, traditionnellement affinée sur de la paille de riz riche en Bacillus sauvage

• Le doenjang et le chunjang sont des pâtes de haricots coréennes à fermentation lente qui contiennent des Bacillus en plus des communautés plus connues d'Aspergillus et de Lactobacillus.

• Les légumes racines crus et non lavés — carottes, betteraves, panais et tubercules extraits d'un sol vivant et sain — portent des spores de B. subtilis à leur surface, ce qui explique en partie pourquoi les cuisines traditionnelles n'ont historiquement pas stérilisé excessivement leurs produits, et pourquoi « manger de la terre » (même de sources saines en très petites quantités) peut être un élément essentiel de la santé.

• Miel sauvage et bien entretenu — le miel récolté dans des ruches entourées de pâturages et de forêts riches en biodiversité abrite des espèces de Bacillus parmi sa signature microbienne plus large [ en savoir plus sur les merveilles microbiennes du miel brut ici ]

• Le foin vieilli, les produits animaux nourris à l'herbe et le lait cru d'animaux au pâturage — B. subtilis a été historiquement appelé bacille du foin car il a d'abord été cultivé à partir de foin ; les aliments provenant d'animaux élevés au pâturage contiennent naturellement cet organisme

En termes biologiques simples, cela signifie que l'exposition à B. subtilis était continue pour nos ancêtres. Il ne s'agissait pas d'un événement hebdomadaire, mais d'une inoculation quotidienne, voire quasi horaire, par contact avec les aliments, l'eau, l'air et le sol. Le mode de vie moderne – cuisines aseptisées, fruits et légumes lavés, produits pasteurisés, aliments emballés sous vide, mains parfaitement propres – a pratiquement éliminé cette exposition pour la plupart des habitants des sociétés industrialisées. De fait, nous avons rompu l'une des plus anciennes relations microbiennes continues de l'histoire de l'évolution humaine.

Ce que cette bactérie fait réellement pour nous

L'importance capitale de Bacillus subtilis pour nos ancêtres n'a rien de romantique, elle est d'ordre biochimique. Cet organisme unique est l'un des producteurs les plus prolifiques de molécules thérapeutiques dans tout le monde microbien. La littérature scientifique évaluée par les pairs sur ses métabolites secondaires compte désormais des milliers d'articles. Voici une liste non exhaustive des composés que Bacillus subtilis produit lorsqu'il est vivant dans nos aliments ou dans notre intestin :

La nattokinase , produite lors de la fermentation du soja, est une sérine protéase dotée d'une puissante activité fibrinolytique : elle dissout la fibrine, la matrice protéique qui assure la cohésion des caillots sanguins.¹⁰ C'est l'un des composés cardiovasculaires naturels les plus étudiés dans la littérature scientifique, avec des effets documentés sur la viscosité sanguine, la plaque d'athérosclérose, la pression artérielle et la fonction circulatoire.¹⁰ ¹¹ Des études menées auprès de la population japonaise ont associé la consommation quotidienne de natto à une mortalité cardiovasculaire plus faible et à un risque d'accident vasculaire cérébral réduit.⁹

La vitamine K2 sous forme de ménaquinone-7 (MK-7) est présente dans le Bacillus subtilis var. natto , qui constitue de loin la source biologique la plus riche en MK-7, la forme à longue chaîne de la vitamine K2 ayant la demi-vie la plus longue dans le sérum humain.⁸ ¹² La MK-7 active l'ostéocalcine (qui dirige le calcium vers les os) et la protéine Gla de la matrice (qui empêche le calcium de se fixer aux parois artérielles). Les implications cliniques sont importantes : la supplémentation en MK-7 a été associée à une réduction de la calcification artérielle, à une amélioration de la densité osseuse chez les femmes ménopausées et à une diminution de la mortalité cardiovasculaire.¹² Une portion de 100 grammes de natto contient environ 1 milligramme de MK-7, une quantité pratiquement impossible à obtenir à partir d'autres aliments.¹²

La surfactine est un lipopeptide cyclique et l'un des biosurfactants les plus puissants connus. Des recherches récentes ont démontré sa capacité à stimuler la production d'IgA sécrétoires, à augmenter la hauteur des villosités intestinales, à réguler positivement les protéines des jonctions serrées (claudine-1, occludine, ZO-1) qui maintiennent l'intégrité de la barrière intestinale et à réduire l'inflammation intestinale dans des modèles de colite induite.¹³ La surfactine possède également une activité antivirale documentée, notamment contre les virus enveloppés, et inhibe la voie VEGF impliquée dans l'angiogenèse tumorale, ce qui en fait une candidate prometteuse en recherche oncologique.¹⁴

La subtilisine et les protéases apparentées sont de puissantes enzymes digestives qui contribuent à la dégradation des protéines alimentaires (y compris les protéines de gluten du blé, difficiles à digérer) et au catabolisme des protéines endommagées dans les tissus. Les protéases de Bacillus subtilis expliquent en partie pourquoi les aliments à base de soja fermenté traditionnels sont plus digestes que le soja non fermenté.

Bactériocines et peptides antimicrobiens. Un vaste arsenal de composés — subtiline, mycosubtiline, fengycine, iturine, plipastatine — dont l'activité est documentée contre les bactéries pathogènes (dont le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline ), les champignons pathogènes (dont Candida albicans ) et certains virus.¹⁴ Ces composés participent au maintien de l'équilibre microbien intestinal par Bacillus subtilis , qui protège contre les infections opportunistes.

Folate, riboflavine, biotine et autres vitamines B. Comme de nombreuses bactéries commensales bénéfiques de l'intestin, B. subtilis contribue directement à la synthèse de cofacteurs essentiels que nos propres cellules ne peuvent pas produire.⁷

Protéines de la couche externe des spores modulant le système immunitaire. Avant même la germination, les spores de B. subtilis interagissent avec le tissu lymphoïde associé à l'intestin (GALT), éduquant le système immunitaire, l'orientant vers la tolérance plutôt que vers la réactivité et contribuant à l'axe intestin-immunité qui détermine une grande partie de notre santé globale.⁷

C’est le principe supra-humain de la biochimie pure. Notre génome humain seul nous empêcherait de synthétiser ces molécules. Nous les empruntons – quotidiennement, de façon ancestrale, par l’alimentation et l’exposition à divers environnements – à un partenaire microbien dont les capacités chimiques dépassent de loin les nôtres.

Tableau clinique : Que se passe-t-il lorsque nous rétablissons la relation ?

Les études sur B. subtilis en tant que complément probiotique ont considérablement progressé ces dernières années, et les résultats cliniques sont cohérents. Un essai pilote ouvert récent, mené par le Centre des sciences appliquées de la santé avec Bacillus subtilis AB22™ à raison de 1 milliard d'UFC par jour pendant six semaines, a mis en évidence, chez des volontaires adultes sains, des améliorations statistiquement significatives de :¹⁵

• Ballonnements (les scores de base ont presque diminué de moitié, passant de 4,0 à 2,0)

• Flatulences (4,3 à 2,6)

• Inconfort abdominal (tendance à l'amélioration)

• Enthousiasme et bien-être (augmentations significatives)

• Fatigue, anxiété et nervosité (diminutions significatives)

• Le TNF-α — une cytokine pro-inflammatoire centrale impliquée dans l'inflammation systémique, la fatigue, les troubles de l'humeur et les maladies chroniques — a montré une diminution statistiquement significative des taux sériques¹⁵

La réduction du TNF-α est, sur le plan biologique, la donnée la plus importante. Elle fournit un ancrage mécanistique mesurable aux améliorations de l'humeur, de l'énergie et du bien-être intestinal : lorsque l'inflammation systémique diminue, l'ensemble de l'axe neuroendocrino-immunitaire se rééquilibre. L'axe intestin-cerveau n'est plus une métaphore ; il s'agit d'une cascade mesurable de cytokines, de métabolites neuroactifs et de signalisation vagale que B. subtilis module de façon démontrée.¹³ ¹⁵

Il s’agit de la forme AB22™ de Bacillus subtilis que j’ai sélectionnée pour CardioNK™ , ma propre formulation régénératrice cardiovasculaire.¹⁶ CardioNK a été construit autour de ce que j’appelle le Complexe Natto Régénératif : un seul ferment ancien fournissant de la nattokinase (2 milliards d’unités formant colonies (UFC) et 10 800 unités fibrinolytiques par dose, ancrées dans la gamme de doses utilisées dans la littérature clinique), le Bacillus subtilis AB22® lui-même et le MK-7 — tous trois provenant du même organisme, travaillant dans la même synergie biologique que celle que nos ancêtres recevaient chaque fois qu’ils mangeaient un bol de natto. Des couches supplémentaires d'acide ellagique hypersoluble EA-613™ et de ptérostilbène sont ajoutées pour un soutien vasculaire et métabolique polyphénolique supplémentaire.¹⁶ La philosophie de conception était simple : au lieu de fragmenter le ferment de natto en molécules isolées et décontextualisées, les livrer comme la nature les a livrées — ensemble, dans leur synergie évoluée, avec l'organisme parent toujours présent.

Découverte Bs-15 : Une réponse microbienne à un problème synthétique

Nous revenons maintenant au sol — et à l'expression la plus profonde de la capacité de B. subtilis à réparer ce que la chimie industrielle a brisé.

En 2015, une équipe de recherche de l'Institut de pomologie du Shandong, en collaboration avec l'Université Rutgers et l'Académie chinoise des sciences agricoles, a publié une étude dans la revue Genetics and Molecular Research, intitulée sans prétention « Biodégradation du glyphosate et bioremédiation potentielle des sols par la souche Bs-15 de Bacillus subtilis ».¹⁷

La souche Bs-15 avait été isolée de la rhizosphère – la fine couche vivante de sol qui entoure les racines des plantes – d'un plant de poivron. Des travaux antérieurs avaient montré que cette souche favorisait la croissance des plantes et freinait les maladies. Yu et ses collègues ont entrepris de vérifier si Bs-15 pouvait accomplir quelque chose d'encore plus remarquable : dégrader une molécule organophosphorée de synthèse résistante à la dégradation chimique, hydrolytique et photolytique.

Les résultats étaient frappants.

La bactérie Bs-15 a non seulement survécu à l'exposition au glyphosate, mais elle s'y est développée avec succès . Elle a toléré des concentrations de glyphosate allant jusqu'à 40 000 mg/L, une concentration bien supérieure à tout ce qu'un écosystème pourrait rencontrer.¹⁷ Elle pouvait utiliser le glyphosate comme source de carbone et de phosphore, ce qui signifie que la molécule que l'industrie considère comme un contaminant permanent était, pour Bs-15, un véritable repas. Dans des conditions optimales, Bs-15 a dégradé environ 65 % du glyphosate en culture liquide en 60 heures. Dans un sol non stérile, où Bs-15 agissait en synergie avec la communauté microbienne indigène, la dégradation a atteint 71,57 % en quatre jours.¹⁷

L'évolution de l'écosystème microbien global suite à l'introduction de Bs-15 s'est révélée encore plus révélatrice. Grâce à l'analyse sur microplaques BIOLOG ECO — une méthode écologique standard pour mesurer la diversité fonctionnelle des communautés microbiennes —, les chercheurs ont constaté que les sols contaminés au glyphosate et inoculés avec Bs-15 présentaient une diversité fonctionnelle significativement supérieure, mesurée par cinq indices distincts (Shannon, uniformité de Shannon, Simpson, McIntosh et uniformité de McIntosh), à celle des sols témoins non inoculés.¹⁷ La bactérie ne se contentait pas de dégrader l'herbicide ; elle restaurant la complexité biologique que ce dernier avait anéantie.

Autrement dit : le Bs-15 régénérait le sol.

Des recherches ultérieures ont approfondi ces observations. Des enzymes glyphosate oxydases modifiées, dérivées d' espèces de Bacillus , ont démontré une efficacité catalytique envers le glyphosate plus de mille fois supérieure, avec une sélectivité accrue pour ce composé par rapport à des molécules apparentées.¹⁸ Une étude de 2023 publiée dans Environmental Microbiology a par ailleurs démontré que B. subtilis s'adapte naturellement à l'exposition au glyphosate non pas principalement par mutation, mais en réduisant l'absorption de l'herbicide – une stratégie de survie remarquablement élégante qui préserve l'intégrité de sa voie métabolique du shikimate.¹⁹ Autrement dit, la bactérie perçoit le glyphosate comme une menace et se protège.

Les fils, tressés

C’est là que se dessine la tendance plus profonde, et que l’approche du microbiome prend tout son sens.

Premièrement, l'extensibilité. Le génome humain est incapable de dégrader le glyphosate. Nos enzymes hépatiques ne le métabolisent pas complètement ; le peu de transformation qui a lieu est en grande partie passive, et la majeure partie de la molécule est excrétée sous une forme structurellement similaire à celle ingérée. De même, notre génome ne peut produire ni nattokinase, ni MK-7, ni surfactine, ni les peptides antimicrobiens qui nous protègent des pathogènes opportunistes. Rien de tout cela ne fait partie de notre holobionte, qui représente 1 % de notre patrimoine génétique. Pourtant, Bacillus subtilis , un organisme vivant à la fois dans le sol et dans nos intestins, et que nous consommons depuis des millénaires, en est capable . C'est le principe supra-humain à l'œuvre. Nous étendons nos capacités biologiques grâce à nos partenaires microbiens. Ce que nous ne pouvons métaboliser, ils le métabolisent pour nous. Ce que nous ne pouvons synthétiser, ils le synthétisent pour nous. Ce contre quoi nous ne pouvons nous défendre, ils nous en protègent. L'holobionte est l'unité de base de la physiologie, et non le corps humain isolé.

Deuxièmement, la continuité. La même espèce qui vit dans la rhizosphère du poivron se retrouve aussi dans le soja fermenté, le miel cru, le foin, les produits laitiers issus de vaches nourries au pâturage et dans notre intestin. Elle circule entre le sol et le corps, entre les champs et le tube digestif, à travers toutes les traditions culinaires que notre espèce a développées. Il n'y a pas de séparation nette. Lorsque l'agriculture industrielle empoisonne le microbiome du sol, elle empoisonne un tissu biologique continu qui inclut le nôtre.

Lorsque nous stérilisons, pasteurisons et lavons chimiquement nos aliments jusqu'à les rendre inertes, nous rompons cette même continuité. À l'inverse, lorsque nous consommons du natto, lorsque nous perpétuons les traditions de fermentation, lorsque nous restaurons le microbiome du sol par l'inoculation de sols sauvages et l'agriculture régénératrice, nous restaurons un organe de notre propre physiologie étendue.

Troisièmement, l'intelligence réparatrice. L'étude sur Bs-15 ne relate pas la victoire d'une seule bactérie sur une toxine unique. Elle décrit la renaissance d'une communauté . Le résultat le plus important de l'article n'est pas le pourcentage de dégradation, mais les indices de diversité fonctionnelle. La présence de Bs-15 a permis à des dizaines d'autres espèces microbiennes, inhibées par le glyphosate, de se rétablir. La bactérie a joué un rôle clé, un point de départ à partir duquel tout un écosystème s'est reconstitué. C'est la signature de l'intelligence biologique à l'échelle de l'écosystème : non pas la logique linéaire « éliminer le pathogène » de la chimie des biocides, mais la logique récursive et génératrice de la vie qui se régénère par l'interaction.

Quatrièmement – ​​l’héritage ancestral. Toutes les cultures ayant survécu à l’industrialisation en conservant une santé cardiovasculaire, osseuse et digestive intacte intégraient Bacillus subtilis à leur alimentation quotidienne. Non pas comme complément alimentaire, mais par tradition. Les Japonais consomment du natto, les Coréens du cheonggukjang, les Népalais du kinema, les Africains de l’Ouest du dawadawa. Les Européens, quant à eux, consommaient des produits laitiers fermentés au foin, des fromages affinés selon des méthodes traditionnelles et des caves où les légumes restaient en contact avec le microbiome du sol. Il ne s’agissait pas d’un hasard nutritionnel, mais, à travers toute l’espèce humaine, de l’expression alimentaire d’une coévolution vieille de plusieurs millions d’années.

Ce que cela signifie

Les implications, replacées dans le contexte de deux décennies de recherche sur le microbiome, sont tout simplement énormes.

Cela signifie que l'herbicide le plus utilisé au monde — une molécule que la science réglementaire a déclarée « sans danger » car elle n'empoisonne pas directement la cellule eucaryote humaine — est, par son mécanisme d'action, un antibiotique contre l'holobionte. Le danger a toujours été présent. Nous n'avions simplement pas le cadre conceptuel nécessaire pour le percevoir.

Cela signifie que notre intestin, notre sol et notre alimentation ne constituent pas des domaines distincts, mais un tissu biologique continu, et que nos actions sur l'un d'eux ont des répercussions sur tous. Le « pont vital » entre l'intérieur et l'extérieur du corps n'a jamais été une métaphore. Il s'agit d'une continuité mesurable, médiée au niveau moléculaire, véhiculée par des organismes comme Bacillus subtilis .

Cela signifie que les bienfaits cardiovasculaires, immunitaires, sur l'humeur et la flore intestinale, documentés dans la littérature clinique sur le natto, la nattokinase et le MK-7, ne sont pas de simples effets nutraceutiques. Il s'agit de la restauration d'une relation, d'une information biologique que nos ancêtres recevaient quotidiennement et que la plupart des humains modernes ont perdue.

Et cela signifie – et c’est peut-être le plus important – que la nature ne nous a pas abandonnés. Même après des décennies d’empoisonnement, les bactéries capables de réparer les dégâts sont toujours là. Toujours présentes dans le sol. Toujours présentes dans la rhizosphère des plantes. Toujours présentes dans les aliments fermentés de toutes les cuisines traditionnelles qui ont survécu. Toujours présentes dans nos intestins, attendant que nous cessions de les éradiquer. Elles attendent. Elles sont prêtes. De par leur métabolisme même, elles sont faites pour la vie.

Le travail de restauration n'est donc ni héroïque ni technologique. Il est humble et écologique. Cessons les pulvérisations. Restaurons les sols. Consommeons des aliments fermentés : natto, dawadawa, kinema, miel cru, aliments crus issus d'une terre vivante. Prenons des probiotiques sporulés, notamment des souches cliniquement validées comme AB22™, lorsque l'accès aux aliments fermentés est limité. Respectons la biodiversité. Reconnaissons enfin que le corps que nous cherchons à soigner ne s'arrête pas à notre peau et que la médecine a toujours été une relation : avec les microbes, avec le sol, entre nous et avec la Terre vivante dont nous n'avons jamais été véritablement séparés.

Bacillus subtilis le savait depuis le début.

Il attendait que nous le rattrapions.

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Les coloriages ajoutés sont un choix de ce blog

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Sayer Ji

·

10 mai

Over the past two decades I’ve built a few things I’m proud of.

Watch now

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Références

1. Samsel, A., & Seneff, S. (2013). Suppression par le glyphosate des enzymes du cytochrome P450 et de la biosynthèse des acides aminés par le microbiome intestinal : voies vers les maladies modernes. Entropy , 15(4), 1416–1463.

2. Mesnage, R., & Antoniou, MN (2020). La modélisation informatique montre que les micro-organismes intestinaux indigènes métabolisent l'herbicide glyphosate. bioRxiv . https://doi.org/10.1101/870105

3. Shehata, AA, Schrödl, W., Aldin, AA, Hafez, HM, & Krüger, M. (2013). L'effet du glyphosate sur les agents pathogènes potentiels et les membres bénéfiques du microbiote aviaire in vitro. Current Microbiology , 66(4), 350–358.

4. Puigbò, P., Leino, LI, Rainio, MJ, Saikkonen, K., Saloniemi, I., & Helander, M. (2022). Le glyphosate affecte-t-il le microbiote humain ? Life , 12(5), 707. (Analyse informatique de la prévalence de la voie du shikimate dans le microbiome intestinal.)

5. Mesnage, R., Teixeira, M., Mandrioli, D., Falcioni, L., Ducarmon, QR, Zwittink, RD, Mazzacuva, F., Caldwell, A., Halket, J., Amiel, C., Panoff, JM, Belpoggi, F., & Antoniou, MN (2021). Utilisation du métagénomique et de la métabolomique shotgun pour évaluer l'impact du glyphosate ou du Roundup MON 52276 sur le microbiote intestinal et le métabolome sérique des rats Sprague-Dawley. Environmental Health Perspectives , 129(1), 017005.

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